Martin Parrot possède une maîtrise de l’École d’Études politiques de l’Université d’Ottawa, où il a rédigé un mémoire publié sous le titre La percée de l’écrit : mouvement de l’existence, littérature, et geste politique dans la philosophie de Jan Patočka. Il a également fait une maîtrise en Humanités à York University, où il a développé une appréciation critique de l’approche de Frances A. Yates à l’hermétisme dans une perspective d’histoire culturelle. Toujours à York, ses recherches doctorales ont pris deux orientations principales : l’étude de l’imagination et de l’épistémologie dans l’histoire et la philosophie française du XXe siècle ; et l’histoire culturelle de la magie et de la sorcellerie de l’Europe et de la Nouvelle-France c. 1600-1800.